More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4556 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 96 aa  192  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  98.96 
 
 		 96 aa  191  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  76.6 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  70.83 
 
 		 96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  74.74 
 
 		 96 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  73.68 
 
 		 96 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  79.79 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  73.68 
 
 		 95 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  75.53 
 
 		 96 aa  146  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  70.83 
 
 		 96 aa  146  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  77.17 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  73.91 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  77.17 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  77.17 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  73.91 
 
 		 94 aa  143  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  73.4 
 
 		 96 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  73.91 
 
 		 96 aa  144  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  70.53 
 
 		 95 aa  143  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  70.53 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  73.91 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  69.47 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  67.37 
 
 		 102 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  70.53 
 
 		 97 aa  141  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  69.47 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  72.53 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  67.02 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  69.89 
 
 		 98 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  65.62 
 
 		 98 aa  137  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  63.37 
 
 		 101 aa  134  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  63.83 
 
 		 101 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  62.77 
 
 		 101 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  78.72 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  59.57 
 
 		 101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  58.7 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  57.61 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  55.91 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  47.31 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  51.69 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  43.62 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  40 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  36.96 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0574  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  38.71 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>