More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5267 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  100 
 
 
96 aa  191  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  98.96 
 
 
96 aa  189  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  97.92 
 
 
96 aa  188  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  97.92 
 
 
96 aa  188  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  97.92 
 
 
96 aa  188  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  97.92 
 
 
96 aa  188  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  97.92 
 
 
96 aa  188  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  97.92 
 
 
96 aa  188  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  97.92 
 
 
96 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  97.92 
 
 
96 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  90.53 
 
 
95 aa  175  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  69.47 
 
 
95 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  65.26 
 
 
95 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  60.42 
 
 
98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  60.42 
 
 
98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  59.38 
 
 
98 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  63.44 
 
 
96 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 
97 aa  122  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  61.29 
 
 
95 aa  121  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  54.35 
 
 
98 aa  111  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  53.76 
 
 
98 aa  110  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  52.17 
 
 
146 aa  107  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  50.53 
 
 
95 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  51.65 
 
 
98 aa  103  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 
95 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  47.37 
 
 
95 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  47.37 
 
 
95 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  46.32 
 
 
95 aa  100  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  42.55 
 
 
94 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  45.26 
 
 
95 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  42.27 
 
 
97 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  38.04 
 
 
95 aa  88.2  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  37.89 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  39.36 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  34.38 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  34.38 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  41.49 
 
 
95 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  42.55 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 
101 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 
101 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  39.36 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  34.74 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  34.74 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  31.25 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  35.16 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  35.11 
 
 
95 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1550  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1433  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  40.43 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  37.63 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  35.11 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  37.23 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  33.68 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  35.87 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  34.38 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>