More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3700 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  100 
 
 		 97 aa  193  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  83.16 
 
 		 95 aa  170  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  79.79 
 
 		 98 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  71.28 
 
 		 101 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  75.79 
 
 		 96 aa  151  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  75 
 
 		 96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  70.21 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  72.63 
 
 		 96 aa  148  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  71.58 
 
 		 96 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  71.88 
 
 		 98 aa  147  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  69.47 
 
 		 96 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  69.57 
 
 		 96 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  68.48 
 
 		 96 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  71.74 
 
 		 96 aa  143  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  69.15 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  69.57 
 
 		 96 aa  143  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  70.65 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  70.65 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  70.65 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  67.74 
 
 		 94 aa  141  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  67.02 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  70.53 
 
 		 96 aa  141  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  69.47 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  67.74 
 
 		 93 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  68.48 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  63.04 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  65.26 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  65.22 
 
 		 111 aa  133  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  67.39 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  68.13 
 
 		 108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  59.57 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  59.78 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  55.79 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  59.34 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  55.67 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  68.13 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  53.68 
 
 		 96 aa  110  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  48.45 
 
 		 98 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  45.65 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  38.71 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  42.7 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  42.7 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0574  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>