More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3361 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  100 
 
 		 155 aa  314  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  59.85 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  59.85 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  65.14 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  65.42 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  69.23 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  64.49 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  69.23 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  69.23 
 
 		 148 aa  156  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  59.83 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  64.76 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  64.76 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  62.86 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  63.81 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  64.42 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  60.95 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  58.41 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  61.9 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  61.9 
 
 		 153 aa  146  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  51.08 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  58.21 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  60.58 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  51.05 
 
 		 168 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  53.54 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  59.62 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  60.58 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  59.05 
 
 		 160 aa  135  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  46.38 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  53.45 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  59.62 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  57.69 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  51.82 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  51.82 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  47.41 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  56.19 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  51.43 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  52.38 
 
 		 117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  53.85 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  50.48 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  44.55 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  35.85 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  41.75 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 109 aa  87  9e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  38.26 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  35 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  39.22 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  40.2 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  35.19 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  39.22 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  39.22 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  32.56 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  38.61 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  34.13 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  36.8 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  35.94 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  38.24 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  40.78 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  31.75 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  31.78 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  30.88 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  31.78 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  38.83 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  31.78 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  31.78 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  37.86 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  34.26 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  34.55 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  31.78 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 95 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  31.78 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  31.01 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  31.01 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  39.81 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>