More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3308 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 95 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  61.05 
 
 		 95 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  56.99 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  55.79 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  51.58 
 
 		 96 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  51.58 
 
 		 96 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  51.58 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  51.58 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  51.58 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  51.58 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  51.58 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  51.58 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  50.53 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  50.53 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  50.53 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  46.24 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  50.54 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  50.54 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  47.92 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 97 aa  97.4  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  48.91 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  48.94 
 
 		 97 aa  96.7  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  45.74 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  47.37 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  45.65 
 
 		 97 aa  94.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  45.65 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  42.11 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  47.83 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  47.37 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  46.24 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  45.65 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  45.65 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  46.74 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  43.75 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  45.65 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  48.39 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  45.65 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  48.39 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  45.65 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  43.48 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 93 aa  90.5  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  43.96 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  46.74 
 
 		 94 aa  90.1  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  44.57 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  45.65 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  42.86 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  43.96 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  43.48 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 96 aa  87.4  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  42.22 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  40.22 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  41.57 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  42.86 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  36.96 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>