More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2503 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  74.23 
 
 		 96 aa  147  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  73.96 
 
 		 95 aa  142  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  58.33 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  61.46 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  61.46 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  61.46 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  61.46 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  57.89 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  60.42 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  56.84 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  55.32 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  55.32 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  55.32 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  56.25 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  55.21 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  48.94 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  40.43 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  44.33 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  44.33 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  38.71 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  43.16 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0024  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  32.63 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  32.99 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  31.25 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>