More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3095 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  100 
 
 
96 aa  195  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  84.38 
 
 
96 aa  170  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  79.17 
 
 
96 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  79.17 
 
 
96 aa  165  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  77.08 
 
 
96 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  77.17 
 
 
94 aa  153  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  72.92 
 
 
96 aa  153  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  69.79 
 
 
96 aa  150  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  71.88 
 
 
96 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  71.88 
 
 
96 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  71.88 
 
 
96 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  72.92 
 
 
96 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  76.09 
 
 
93 aa  147  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  69.47 
 
 
97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  65.62 
 
 
96 aa  144  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  68.75 
 
 
96 aa  144  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  72.53 
 
 
111 aa  143  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  69.47 
 
 
96 aa  142  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  64.89 
 
 
101 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  69.15 
 
 
96 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  71.28 
 
 
118 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  66.32 
 
 
95 aa  141  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  67.02 
 
 
98 aa  140  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  68.42 
 
 
96 aa  140  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  65.62 
 
 
95 aa  140  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  63.83 
 
 
101 aa  140  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  68.82 
 
 
98 aa  135  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  66.67 
 
 
102 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  63.64 
 
 
101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  61.05 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  68.13 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  57.61 
 
 
96 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  54.26 
 
 
101 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  57.61 
 
 
95 aa  120  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  58.06 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  70.21 
 
 
108 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
96 aa  103  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  50.54 
 
 
98 aa  102  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  42.55 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  38.04 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  43.48 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  45.45 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  39.13 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  39.13 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  37.23 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  38.71 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  40 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  38.04 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  37.23 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  34.78 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  34.38 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  35.87 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  34.04 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  36.84 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  40.22 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1046  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000381184  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_917  ribosomal protein S6  36.78 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000118903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  39.08 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>