More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2394 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  100 
 
 
95 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  58.51 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  55.79 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  53.19 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  48.42 
 
 
95 aa  106  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 
98 aa  105  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  50.53 
 
 
95 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  51.06 
 
 
94 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  52.75 
 
 
95 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  45.26 
 
 
95 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 
95 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 
95 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 
95 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  48.42 
 
 
95 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  45.26 
 
 
96 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 
96 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 
95 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  47.87 
 
 
95 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 
96 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  44.09 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 
96 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  44.09 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  45.26 
 
 
131 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  45.16 
 
 
129 aa  90.5  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  45.05 
 
 
168 aa  90.5  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  45.16 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
122 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
125 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
122 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
122 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
125 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  43.16 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  43.16 
 
 
94 aa  88.6  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  45.16 
 
 
125 aa  87.4  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  44.09 
 
 
129 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 
98 aa  87  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
124 aa  87.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  41.3 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  42.11 
 
 
97 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  39.13 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  41.3 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  40 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  43.01 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  38.95 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  40.43 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  36.84 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  38.95 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
141 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
141 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
141 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5662  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  41.3 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65180  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
141 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  41.05 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0534  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  44.09 
 
 
176 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 
139 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 
135 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0645  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 
140 aa  84  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.793975  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 
139 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>