More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0849 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  100 
 
 		 147 aa  299  7.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  42.39 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  41.94 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  41.3 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  42.22 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  38.71 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  35.59 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  40.22 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  35.59 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  35.87 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>