More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1219 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  88.42 
 
 		 98 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  57.3 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  57.14 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  53.68 
 
 		 97 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  57.3 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  55.91 
 
 		 94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  57.3 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  53.19 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  56.18 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  56.18 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  56.18 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  52.75 
 
 		 96 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  51.65 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  52.81 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  52.75 
 
 		 95 aa  104  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  51.69 
 
 		 101 aa  103  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  55.06 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  51.65 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  55.56 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  52.13 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  50.55 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  56.04 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  51.69 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  50.56 
 
 		 96 aa  99  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  51.65 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  50 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  50.55 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  47.37 
 
 		 111 aa  95.9  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  50.55 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  53.19 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  47.19 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  51.69 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  50.56 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  45.83 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 95 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 95 aa  87.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 95 aa  87.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  52.17 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  44.44 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  42.22 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  40 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  38.89 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  40 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  40.45 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  38.89 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  40.45 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  32.14 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 97 aa  66.6  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  33.71 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  32.58 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  34.41 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>