158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0024 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0024  30S ribosomal protein S6  100 
 
 
137 aa  274  2e-73  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl080  30S ribosomal protein S6  62.79 
 
 
290 aa  179  1e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  1.25992e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 
98 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 
98 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  40.22 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
95 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  39.39 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  38.95 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  34.07 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  30.83 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  30.85 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  32.95 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  26.61 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  32.95 
 
 
109 aa  53.5  0.0000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  30 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  31.52 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1358  ribosomal protein S6  29.81 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  30.65 
 
 
161 aa  50.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  27.47 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 
117 aa  50.1  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  20.86 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  32.61 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  32.95 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  27.36 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  23.14 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  30.34 
 
 
96 aa  48.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  24.79 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  24.44 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  31.58 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  30.11 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  26.6 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  30.48 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  23.33 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 
96 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 
96 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  29.17 
 
 
145 aa  47  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  30.48 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  24.09 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  28.72 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  32.58 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  30.43 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  28.72 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  28.72 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  27.01 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  25.19 
 
 
139 aa  47  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  26.97 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  28.57 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  26.37 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  28.72 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  31.46 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  30.43 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  30.43 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>