More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1363 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 97 aa  197  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  48.89 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  42.71 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3402  ribosomal protein S6  38.32 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301569  normal  0.342869 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  41.11 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1526  ribosomal protein S6  38.32 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.506351  normal  0.0309301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  38.3 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  41.49 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  37.78 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  41.11 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  39.77 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  39.53 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  39.53 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  40.23 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  34.34 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  36.78 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2389  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  41.84 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>