More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0007 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 98 aa  200  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  68.82 
 
 		 98 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  67.02 
 
 		 96 aa  133  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  65.59 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  61.96 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  52.58 
 
 		 98 aa  116  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  56.84 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  54.35 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  53.26 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  53.26 
 
 		 96 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  53.26 
 
 		 96 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  53.26 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  53.26 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  53.26 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  53.26 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  53.26 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  53.26 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  52.17 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  48.94 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  48.91 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  36.17 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  32.26 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  33.68 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  37.23 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  35.56 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1337  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.021992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1032  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  34.34 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>