More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0455 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 148 aa  297  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  99.32 
 
 		 156 aa  296  9e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  97.14 
 
 		 151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  71.63 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  71.63 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  70.83 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  76.42 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  65.87 
 
 		 136 aa  169  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  74.04 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  70.64 
 
 		 151 aa  163  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 134 aa  159  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  69.23 
 
 		 155 aa  157  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  68.87 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  65.74 
 
 		 134 aa  157  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  68.27 
 
 		 146 aa  156  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  63.5 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  64.46 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  64.15 
 
 		 151 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  64.15 
 
 		 151 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  63.46 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  61.9 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  66.35 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  61.72 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  63.21 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  64.42 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  64.42 
 
 		 139 aa  143  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  57.53 
 
 		 168 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  49.63 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  58.33 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  53.1 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  57.55 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  50.91 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  50.91 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  52.21 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  50.94 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  50.94 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  52.83 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  50.69 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  47.66 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  46.53 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  46.53 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  41.59 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  43.27 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  41.59 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  44.55 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  43.24 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  35.86 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  44.55 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  44.55 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3037  30S ribosomal protein S6  45.54 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  40.65 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  38.05 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  44.55 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  36.54 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  43.56 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  37.17 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  37.07 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  36.28 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  36.28 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  37.19 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  36.28 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  34.59 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  34.81 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  34.81 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2830  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  36.63 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0645  30S ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.793975  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>