More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3037 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3037  30S ribosomal protein S6  100 
 
 
121 aa  250  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  97.52 
 
 
121 aa  246  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  85.95 
 
 
121 aa  226  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  86.78 
 
 
125 aa  226  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  86.78 
 
 
124 aa  223  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  85.95 
 
 
125 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  85.95 
 
 
125 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  85.83 
 
 
120 aa  217  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  86.21 
 
 
141 aa  213  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  79.34 
 
 
122 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2830  30S ribosomal protein S6  74.38 
 
 
121 aa  196  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  72.41 
 
 
124 aa  190  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  67.77 
 
 
124 aa  190  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  71.93 
 
 
124 aa  189  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  71.93 
 
 
124 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  71.79 
 
 
122 aa  188  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  70.69 
 
 
124 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  67.8 
 
 
124 aa  184  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  181  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  181  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  180  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  180  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 
124 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  72.64 
 
 
122 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  72.64 
 
 
122 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  67.31 
 
 
131 aa  163  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  67.96 
 
 
142 aa  159  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  62.07 
 
 
125 aa  157  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  56.25 
 
 
128 aa  157  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  65.38 
 
 
127 aa  153  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  64.42 
 
 
127 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  58.68 
 
 
122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  57.5 
 
 
134 aa  150  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  57.5 
 
 
134 aa  150  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  56.78 
 
 
136 aa  149  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  60.58 
 
 
145 aa  149  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  61.54 
 
 
143 aa  147  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  55.93 
 
 
130 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  55.93 
 
 
134 aa  147  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  62.5 
 
 
129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  55.93 
 
 
135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  57.89 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  56.64 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  55.93 
 
 
139 aa  144  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  55.74 
 
 
133 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  55.08 
 
 
139 aa  144  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2052  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 
143 aa  144  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  54.24 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0927  30S ribosomal protein S6  60.19 
 
 
126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0134622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  52.54 
 
 
119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1087  30S ribosomal protein S6  57.52 
 
 
127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000589418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  59.65 
 
 
129 aa  144  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  55.56 
 
 
135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  54.31 
 
 
114 aa  143  8.000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  56.67 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2133  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 
143 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0657  30S ribosomal protein S6  51.28 
 
 
119 aa  142  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  56.14 
 
 
131 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  56.14 
 
 
131 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  55.08 
 
 
131 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  56.14 
 
 
131 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  56.14 
 
 
131 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  57.02 
 
 
135 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  55.83 
 
 
130 aa  141  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  52.99 
 
 
137 aa  140  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1550  30S ribosomal protein S6  59.62 
 
 
112 aa  140  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1433  30S ribosomal protein S6  59.62 
 
 
112 aa  140  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  140  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  53.33 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0732  30S ribosomal protein S6  53.39 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00282194  hitchhiker  0.0000000108888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3643  30S ribosomal protein S6  53.39 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0741  30S ribosomal protein S6  53.39 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000275832  hitchhiker  0.000127866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0711  30S ribosomal protein S6  53.39 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.165791  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  57.69 
 
 
125 aa  137  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  51.67 
 
 
132 aa  137  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  55.14 
 
 
138 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>