More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2512 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 126 aa  254  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  63.89 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  62.73 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  62.73 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  71.58 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  71.58 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  71.58 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  56.9 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  57.02 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  56.36 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  60.58 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  56.36 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  59.62 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  65.96 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  57.55 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  57.55 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  62.77 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  56.6 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  56.14 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  60.82 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  58.95 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  49.58 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  56.7 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  57.14 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  55.67 
 
 		 168 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  57.89 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  54.64 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  55.79 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  55.79 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  54.74 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  54.74 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  56.84 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  52.63 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  52.63 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  54.74 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  54.74 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  51.55 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  48.15 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  36.89 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  37.4 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  35.88 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  38.1 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  38.1 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  35.77 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  35.77 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  35.77 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  34.71 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  36.29 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  37.4 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  37.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  37.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  35.9 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  35.2 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  38.26 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  36 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  33.04 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  36 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  33.04 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  33.6 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  34.45 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  33.87 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  33.87 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  34.21 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  33.87 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  36.94 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  32.56 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  33.58 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  33.6 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  34.45 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  33.87 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  36.54 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>