More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0494 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  100 
 
 
136 aa  278  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  73.45 
 
 
145 aa  175  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  72.97 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  72.97 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  70.91 
 
 
134 aa  170  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  70 
 
 
134 aa  168  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  71.43 
 
 
151 aa  166  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  70.48 
 
 
148 aa  166  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  70.48 
 
 
156 aa  165  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  70.75 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  70.19 
 
 
148 aa  157  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  63.21 
 
 
151 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  63.21 
 
 
151 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  63.21 
 
 
151 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  64.86 
 
 
151 aa  154  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  62.5 
 
 
155 aa  152  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  65.38 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  63.46 
 
 
146 aa  150  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  65.38 
 
 
160 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  64.42 
 
 
158 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  64.15 
 
 
152 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  64.42 
 
 
159 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  63.46 
 
 
147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  60.38 
 
 
139 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  61.54 
 
 
168 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  57.02 
 
 
126 aa  140  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  59.26 
 
 
120 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  52.78 
 
 
117 aa  124  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  51.89 
 
 
122 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  50 
 
 
160 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  46.3 
 
 
132 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  46.3 
 
 
135 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  43.9 
 
 
132 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  52.38 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  44.96 
 
 
161 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  45.28 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  46.23 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  43.4 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  44.34 
 
 
117 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  44.23 
 
 
142 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  41.28 
 
 
141 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  36.51 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  36.51 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  37.96 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  39.62 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  40.74 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  38.74 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  39.81 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  37.04 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  39.81 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  39.81 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  38.53 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  45.05 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  39.84 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  45.05 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5662  30S ribosomal protein S6  43.27 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65180  30S ribosomal protein S6  43.27 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  37.61 
 
 
124 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  39.6 
 
 
122 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  37.74 
 
 
124 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  39.6 
 
 
122 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  37.61 
 
 
124 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  37.74 
 
 
124 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  35.54 
 
 
128 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  34.62 
 
 
109 aa  82  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  40 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  39.52 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3037  30S ribosomal protein S6  40.74 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  41.35 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  42 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  42.72 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  38.66 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  39.32 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  38.66 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  38.66 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  38.98 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  40.38 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  40.38 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  40.38 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  40.38 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  35.09 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  40.38 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  40.38 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  37.4 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  40.54 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  40.54 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2830  30S ribosomal protein S6  37.96 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>