More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1212 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  55.56 
 
 		 155 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  55.56 
 
 		 155 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  55.66 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  51.72 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  56.14 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  55.77 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  52.88 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  55.66 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  50.46 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  52.78 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  52.38 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  52.38 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  52.38 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  53.77 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  50.94 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  46.36 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  46.36 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  51.89 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  49.06 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 159 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  46.96 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  52.21 
 
 		 161 aa  115  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  48.08 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  47.17 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  46.23 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  47.17 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  46.3 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  48.57 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  41.12 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  40.18 
 
 		 122 aa  87  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  40.35 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  40.52 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  37.84 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  38.74 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  40.87 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2052  30S ribosomal protein S6  39.82 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2133  30S ribosomal protein S6  39.82 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3419  ribosomal protein S6  38.79 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797124  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  41.35 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  43.1 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  37.72 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  37.72 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  37.5 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  33.91 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  38.26 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  37.72 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  37.72 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  38.61 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0657  30S ribosomal protein S6  35.65 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  39.47 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  35.09 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  36.04 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  35.09 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>