More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1622 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 117 aa  243  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  85.59 
 
 		 132 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  85.59 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  84.68 
 
 		 132 aa  199  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  85.85 
 
 		 117 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  83.02 
 
 		 117 aa  194  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  81.13 
 
 		 131 aa  186  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  52.83 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  56.48 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  56.48 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  54.63 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  52.14 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  55.66 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  52.29 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  52.38 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  52.78 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  52.78 
 
 		 145 aa  126  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  51.89 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  52.38 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  51.89 
 
 		 146 aa  123  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  50.96 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  50.96 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  50.96 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  50.89 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  47.62 
 
 		 154 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  47.17 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  47.17 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  47.17 
 
 		 160 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  50.47 
 
 		 122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  46.23 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  43.7 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 168 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  47.22 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  41.35 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  37.14 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  36.19 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  31.62 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  34.04 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2830  30S ribosomal protein S6  34.23 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  33.63 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  33.63 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  33.63 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  33.63 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  36.63 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  31.78 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  32.48 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  32.14 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  30.7 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  36.11 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>