More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2462 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  40.95 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  41.75 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  33.98 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  33.98 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  30.17 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  34.95 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  33.93 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  33.98 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  34.95 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  34.95 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  34.95 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  33.01 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  33.01 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  33.98 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  40.38 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  33.01 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  33.01 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  30.1 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  38.78 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  31.07 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  38.38 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  32.76 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  36.63 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  31.93 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  31.68 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0122  ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  30.58 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0136  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0125  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  34.68 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  29.5 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  29.46 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  31.67 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  32.77 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0118  SSU ribosomal protein S6P  36.96 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  34.15 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  31.67 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  30.43 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  33.88 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  30.89 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  29.71 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  29.71 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  29.71 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  29.71 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  29.71 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  34.82 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  29.71 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  29.71 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>