272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0122 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0122  ribosomal protein S6  100 
 
 
150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0136  ribosomal protein S6  85.6 
 
 
148 aa  226  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0125  ribosomal protein S6  85.6 
 
 
148 aa  226  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0118  SSU ribosomal protein S6P  85.6 
 
 
148 aa  226  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  40 
 
 
210 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  37.76 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  39.18 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  38.89 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  31.68 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  39.18 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  27.41 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  28.89 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
101 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  30.21 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  27.13 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  28.09 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  28.09 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  30.08 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  32.65 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  30.6 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  26.6 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  26.09 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  29.5 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  30.6 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  30.6 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
122 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  24.72 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  26.97 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  25 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  26.32 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  25.84 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 
120 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  27.42 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  29.35 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  30 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
158 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  32.12 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  30 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  29.36 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  26.85 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  25 
 
 
95 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 
148 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  25.51 
 
 
168 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  31 
 
 
128 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
159 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  31.01 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 
151 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  29.17 
 
 
122 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  32.77 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  31.88 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  26.26 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  28.12 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  24.72 
 
 
117 aa  50.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  27.37 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0558  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.457125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  25.86 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  28.72 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  29.35 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  25.86 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  28.09 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  29.29 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  23.73 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  36.51 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  31.31 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>