More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1131 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  76.38 
 
 		 145 aa  196  7e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  73.81 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  74.19 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  72.95 
 
 		 124 aa  176  9e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  70.16 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  70.16 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  69.35 
 
 		 125 aa  170  5e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  61.54 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  49.55 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  48.39 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  41.24 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  39.8 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  41.94 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  34.96 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  44.68 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  38.32 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0451  30S ribosomal protein S6  40.45 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000202528  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  43.3 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  37.21 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  36.61 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  36.8 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000995265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  41.11 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  35.77 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  41.94 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0184  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0114  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  34.48 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  36.46 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  34.31 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  32.95 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>