More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0094 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 132 aa  266  8e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0114  30S ribosomal protein S6  77.17 
 
 		 133 aa  207  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0147  30S ribosomal protein S6  71.76 
 
 		 133 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000969846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  79.31 
 
 		 134 aa  196  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2512  30S ribosomal protein S6  70.08 
 
 		 133 aa  186  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  60.66 
 
 		 135 aa  159  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  57.98 
 
 		 134 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  38.61 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  46.07 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  45.05 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  45.05 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  43.96 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  32.54 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  35.11 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  35.56 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  35.42 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  40.48 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  32.95 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0184  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  34.07 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  35.23 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  29.91 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  33.64 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  31.76 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  34.62 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3419  ribosomal protein S6  31.31 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797124  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  35.9 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  36.47 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  36 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  32.26 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3402  ribosomal protein S6  36.61 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301569  normal  0.342869 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0574  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  31.46 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  35.29 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0927  30S ribosomal protein S6  29.91 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0134622  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>