More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0158 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  77.78 
 
 		 134 aa  203  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0147  30S ribosomal protein S6  64.12 
 
 		 133 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000969846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0114  30S ribosomal protein S6  64.06 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2512  30S ribosomal protein S6  65.65 
 
 		 133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  67.52 
 
 		 134 aa  167  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  60.66 
 
 		 132 aa  159  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  35.09 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  35.29 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  26.23 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  28.87 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  35.23 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  29.17 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  26.92 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  31.15 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  27.47 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  26.37 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  30.77 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  27.64 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  29.89 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  29 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  22 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  28.09 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  29.03 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  27.47 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  22 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  31.11 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  27.27 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  26.97 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  27.47 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  26.97 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0184  30S ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312972  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  39.62 
 
 		 168 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  28.09 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2377  ribosomal protein S6  32.91 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.21684e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  25 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  30.95 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>