More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2591 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  63.33 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  61.02 
 
 		 124 aa  153  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  55.17 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  62.39 
 
 		 117 aa  143  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  59.05 
 
 		 113 aa  140  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  54.29 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  51.69 
 
 		 127 aa  129  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  56.88 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  43.86 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  36.89 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  37.96 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  37.96 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  36.89 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  34.95 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  34.95 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  33.98 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  26.89 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  36.59 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  36 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  34.34 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  35.04 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  35.04 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2512  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  35.77 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  34.19 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  31.43 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  32.18 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0147  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000969846  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  35.63 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0114  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  31.93 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  31.93 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>