251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0399 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  51.69 
 
 		 121 aa  129  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  55.26 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  52.83 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  47.54 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  50.48 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  44.72 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  48.57 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  49.07 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  33.87 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  29.17 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  30.89 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  32.95 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0451  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000202528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  35.34 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  26.97 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  29.52 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  29.52 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  32.63 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  35.23 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  26.67 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  29.52 
 
 		 132 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  27.59 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  32.56 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  25.25 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  26.26 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1358  ribosomal protein S6  28.74 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  25.56 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  26.37 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  28.74 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0711  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.165791  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  25.74 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  32.95 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  26.44 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3643  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  29.89 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0741  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000275832  hitchhiker  0.000127866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0732  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00282194  hitchhiker  0.0000000108888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>