259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1358 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1358  ribosomal protein S6  100 
 
 
104 aa  214  4e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  39.56 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  31.87 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  35.16 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  30.77 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
96 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  31.82 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  36.26 
 
 
94 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  37.36 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  31.68 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  28.74 
 
 
95 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  33.33 
 
 
98 aa  60.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0451  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000202528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  25.56 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  35.16 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  32.41 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  29.76 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  34.07 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  32.95 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  34.07 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  35.16 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  34.38 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  28.89 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  32.97 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  27.17 
 
 
106 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  33.33 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  26.37 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  31.52 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  29.89 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  28.57 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1476  ribosomal protein S6  30.59 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.46836 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  29.76 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  28.41 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 
95 aa  53.5  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 
95 aa  53.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  31.87 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  27.47 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  29.63 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  32.18 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  31.03 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  31.82 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  29.67 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  26.67 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  31.11 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  28.89 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  32.22 
 
 
111 aa  52  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  28.09 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 
96 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 
96 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 
108 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  28.74 
 
 
129 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0024  30S ribosomal protein S6  29.81 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  27.27 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  32.29 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>