68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1476 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1476  ribosomal protein S6  100 
 
 		 94 aa  193  5.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.46836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  32.94 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  27.38 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1358  ribosomal protein S6  30.59 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  30.12 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2287  ribosomal protein S6  27.47 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1046  30S ribosomal protein S6  27.06 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000381184  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_917  ribosomal protein S6  27.06 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000118903  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  27.06 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  31.76 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  28.24 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  30.49 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  27.06 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  28.24 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.33 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  25.88 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  30.59 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  27.06 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  30.49 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  25.88 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  24.71 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1678  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000685553  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  27.06 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  26.83 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  25.88 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  28.05 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  28.24 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  26.51 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  27.06 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  28.24 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  25.61 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  25.88 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  24.71 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  27.06 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  28.05 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  24.39 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  25.88 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  22.35 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  25 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  28.24 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  25.61 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  25.88 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 101 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  28.24 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  29.27 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  28.24 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  23.53 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  28.24 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  28.24 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  24.71 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  25.61 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  21.88 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  24.71 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  24.71 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  24.71 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  28.09 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  28.05 
 
 		 135 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>