More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1585 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  92.25 
 
 		 139 aa  261  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  69.77 
 
 		 145 aa  187  5.999999999999999e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  74.19 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  78.57 
 
 		 125 aa  179  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  78.57 
 
 		 125 aa  179  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  77.68 
 
 		 124 aa  179  9.000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  77.68 
 
 		 125 aa  177  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  53.1 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  48.6 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  50.54 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  40.38 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  39.8 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  39.6 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  41.94 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  33.9 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  37.96 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  31.4 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  39.53 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  30.4 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0184  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 155 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 155 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 97 aa  67  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  41.94 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  38.04 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  35.63 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  40.23 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>