More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0162 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 134 aa  274  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  77.78 
 
 		 135 aa  203  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0114  30S ribosomal protein S6  63.85 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2512  30S ribosomal protein S6  66.12 
 
 		 133 aa  167  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0147  30S ribosomal protein S6  60.9 
 
 		 133 aa  167  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000969846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  64.1 
 
 		 134 aa  160  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  57.98 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  36.9 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  34.88 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  30.93 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  36.05 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  34.52 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  35.23 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  34.52 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  34.52 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  34.52 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  34.52 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  36.9 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  32.94 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  30.34 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  32.14 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  32.95 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  34.52 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  28.09 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  32.95 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  27.47 
 
 		 95 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  30.95 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  30.95 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  30 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  27.55 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  30.34 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  29.2 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  25.96 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  26.6 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  28.41 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  24.8 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  25.21 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>