More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0758 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  74.77 
 
 		 122 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  63.64 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  61.82 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  60.91 
 
 		 134 aa  137  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  61.29 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  43.56 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  39.8 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  39.8 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  39.8 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  36.96 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  35.66 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  35.66 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  31.78 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  41.38 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  34.34 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  37 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  36.45 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  39.77 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  36.45 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3419  ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797124  normal  0.172954 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  34.58 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0657  30S ribosomal protein S6  32.71 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  33.93 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  39.08 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0574  ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2830  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  39.77 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 210 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  33.64 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  35.25 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  31.4 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0711  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.165791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3643  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0732  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00282194  hitchhiker  0.0000000108888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0741  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000275832  hitchhiker  0.000127866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>