More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2030 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 101 aa  203  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  88.12 
 
 		 101 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  76.24 
 
 		 101 aa  161  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  70.1 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  52.63 
 
 		 105 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  50.5 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  36.63 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  41.76 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  38.14 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  37.37 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  39.39 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  36.56 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0122  ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  26.32 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0125  ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0136  ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0118  SSU ribosomal protein S6P  35.71 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1337  30S ribosomal protein S6  32.32 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.021992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  29.17 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  28.71 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  26.32 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  31.31 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  27.84 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1032  30S ribosomal protein S6  32.32 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  28.42 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>