274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0136 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0125  ribosomal protein S6  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0136  ribosomal protein S6  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0118  SSU ribosomal protein S6P  97.3 
 
 		 148 aa  250  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0122  ribosomal protein S6  85.61 
 
 		 150 aa  233  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 210 aa  97.1  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  39.8 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  37.89 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  27.48 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  26.92 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  28.12 
 
 		 115 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  25 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  26.97 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  26.97 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  28.09 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  26.6 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  32.17 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  25 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  32.56 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  29.63 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  32.93 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  25.77 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  29.29 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  25.84 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  26.44 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  26.95 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0558  30S ribosomal protein S6  27.48 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.457125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  28.24 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  25 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  26.32 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  22.33 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  30.3 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3037  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  28.79 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  33.33 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  28.79 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  26.67 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  26.67 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  27.94 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0114  30S ribosomal protein S6  27 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  26.67 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  26.32 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>