285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0558 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0558  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.457125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0675  30S ribosomal protein S6  44.63 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000724488  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  45 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000995265  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  46.3 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0636  30S ribosomal protein S6  41.12 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000427739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  34.34 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  34.74 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  34.31 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  35.42 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_917  ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000118903  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1046  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000381184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  29.13 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  31.67 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  29.13 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  29.13 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  30.1 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  29.9 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  29.75 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  28.87 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  28.87 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  28.87 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  33.04 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  27.27 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  28.87 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  30.36 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  27.84 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  29.29 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0122  ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  36 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  27.59 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  31.75 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  28.87 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  27.08 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0118  SSU ribosomal protein S6P  26.27 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0125  ribosomal protein S6  26.27 
 
 		 148 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2052  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>