More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4806 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  100 
 
 		 176 aa  348  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  57.48 
 
 		 124 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  56.69 
 
 		 124 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  59.14 
 
 		 108 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  57.89 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  59.55 
 
 		 107 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  43.38 
 
 		 138 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  42.75 
 
 		 126 aa  107  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  57.3 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  53.93 
 
 		 124 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  44.72 
 
 		 124 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  51.69 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  41.46 
 
 		 152 aa  97.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  48.31 
 
 		 174 aa  97.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  42.62 
 
 		 153 aa  95.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 95 aa  94  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 128 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 95 aa  84.3  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 95 aa  84.3  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 112 aa  83.6  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  34.06 
 
 		 125 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  40.4 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  37.14 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  37.07 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  37.14 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  38 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  38 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  37 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  35.87 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  38 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  33.91 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  36.56 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  33.91 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  33.91 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  34.23 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  33.04 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  36 
 
 		 142 aa  72  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  38 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  36.46 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  35 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  35 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  35 
 
 		 122 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  31.9 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>