239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0451 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0451  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 112 aa  233  7e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000202528  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  46.15 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  43.82 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  40.45 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1358  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  27.47 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  28.09 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0184  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312972  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  27.47 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  32.18 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0675  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000724488  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  28.74 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  26.97 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  26.97 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  28.09 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000995265  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 106 aa  52  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  28.74 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  28.74 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  25.77 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  26.44 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  28.12 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  29.89 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  23.66 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  29.17 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  25 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  28.74 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  28.09 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  25.77 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  23.16 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  22.58 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  25.26 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  29.89 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  28.12 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5910  ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  26 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  25.51 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  25.77 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  22.68 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  26.67 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  28.41 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>