275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5910 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5910  ribosomal protein S6  100 
 
 
124 aa  250  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  38.04 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  34.83 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  34.83 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  34.74 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 
95 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  30.77 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 
96 aa  59.3  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  36.67 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  31.96 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  35.56 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  32.41 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  33.71 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  30.77 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  34.44 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  36.36 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  26.85 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  30.34 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  27.27 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  28.28 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  25.93 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  36.11 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  29.29 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  26.26 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  28.09 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  31.46 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  36.11 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  32 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  27.55 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  33.78 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  28.28 
 
 
131 aa  53.9  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  29.79 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  30.69 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  30.69 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  26.26 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
122 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  26.26 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
122 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  37.84 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  26.26 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  25.25 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  36.49 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  36.92 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  24.24 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  28.09 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1057  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.66834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  30.69 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  27.47 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  31.37 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  37.5 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 
139 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 
126 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  33.8 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  25.25 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>