More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1114 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  100 
 
 		 124 aa  257  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  59.84 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  61.02 
 
 		 121 aa  153  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  54.7 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  54.95 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  57.5 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  54.05 
 
 		 113 aa  133  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  55.26 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  50.88 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  53.54 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  29.51 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  37.96 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  33.93 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  37.04 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  38.32 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  36.28 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  36.28 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  36.28 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  43.96 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  37.36 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  35.4 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  39.77 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  39.13 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  32.95 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  32.95 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  31 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  31.07 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  32.95 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  30.51 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  35.23 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  30.93 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  27.64 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  35.23 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_917  ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000118903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1046  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000381184  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  25.81 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  25.81 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  31.4 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0166  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000100451  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  24.73 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>