278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0166 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0166  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 102 aa  207  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000100451  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1778  30S ribosomal protein S6  48.51 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000639797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0827  ribosomal protein S6  51.49 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.31536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  31.73 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1337  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.021992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1032  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  30 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  25 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  30.1 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  30.43 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  32 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  32.18 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3419  ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797124  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  31.52 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  26.37 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  26.6 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  28.43 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  28.43 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  26.09 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  30.11 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  26.6 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  25.53 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  27.47 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  29 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>