More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1844 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1844  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2470  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 
185 aa  91.3  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035562 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0970  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
180 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0797  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  44.23 
 
 
334 aa  84.7  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 
631 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  36.55 
 
 
469 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  33.12 
 
 
848 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  33.08 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  36.57 
 
 
458 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  37.4 
 
 
771 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  34.16 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  34.35 
 
 
453 aa  72.8  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
642 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 
358 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
642 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  35.38 
 
 
474 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
642 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
496 aa  72  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
643 aa  72  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0101  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
360 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.64 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  32.21 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
643 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
643 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
643 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3786  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 
456 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
643 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
346 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
359 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  31.36 
 
 
420 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.35 
 
 
492 aa  68.6  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 
358 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.86 
 
 
880 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  37.62 
 
 
419 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.86 
 
 
860 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 
470 aa  67.4  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 
487 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 
814 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 
389 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  33.08 
 
 
1301 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
320 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  35.97 
 
 
358 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 
324 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1949  metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000478205  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 
495 aa  65.9  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
369 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  32.21 
 
 
417 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 
615 aa  65.5  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2799  metal-dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 
422 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0938025  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  37.25 
 
 
446 aa  65.5  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 
480 aa  65.5  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 
360 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3863  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.383741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3977  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.750447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01587  HD-GYP domain protein  31.3 
 
 
379 aa  65.1  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  33.11 
 
 
329 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  33.1 
 
 
876 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
389 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 
545 aa  64.3  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  35.56 
 
 
1171 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4714  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.1 
 
 
684 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
422 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  38.39 
 
 
304 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 
419 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 
364 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
388 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  31.97 
 
 
471 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
363 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 
683 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 
343 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 
357 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
438 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
247 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 
960 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 
521 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3375  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 
324 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  33.87 
 
 
395 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  33.08 
 
 
420 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 
384 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
861 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 
357 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 
432 aa  62.8  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  31.47 
 
 
421 aa  62.4  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  37.86 
 
 
401 aa  62.4  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 
407 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.33 
 
 
345 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
417 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 
648 aa  62.4  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
428 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>