More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0970 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0970  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
180 aa  371  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2470  metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 
185 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035562 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0797  metal dependent phosphohydrolase  37.75 
 
 
204 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
389 aa  89.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1844  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
213 aa  89  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 
502 aa  88.6  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
518 aa  87.8  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 
495 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.42 
 
 
860 aa  86.3  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  35.22 
 
 
648 aa  86.3  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 
446 aa  86.3  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.42 
 
 
880 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  36.88 
 
 
651 aa  85.9  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 
505 aa  85.9  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  40.15 
 
 
358 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 
452 aa  85.1  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3786  metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 
456 aa  84.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
366 aa  84  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  34.73 
 
 
712 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  39.86 
 
 
360 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 
643 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 
643 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 
643 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  36.53 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 
643 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 
419 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.27 
 
 
357 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  36.69 
 
 
632 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  35.37 
 
 
439 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 
1073 aa  82  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
392 aa  82  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
419 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
407 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  35.37 
 
 
392 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.98 
 
 
384 aa  82  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.01 
 
 
480 aa  82  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 
481 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2866  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
432 aa  80.9  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128247  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 
363 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
642 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
642 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 
683 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  37.12 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  36.96 
 
 
465 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
642 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
339 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 
371 aa  78.6  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  33.93 
 
 
404 aa  78.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  37.09 
 
 
710 aa  79  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
428 aa  78.6  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  32.76 
 
 
351 aa  78.2  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 
347 aa  78.2  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 
364 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 
643 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  33.54 
 
 
453 aa  78.2  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
545 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 
462 aa  77.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 
334 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 
348 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 
471 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 
369 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
470 aa  77  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
703 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  33.33 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  36.2 
 
 
469 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.88 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
703 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  36.6 
 
 
421 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2492  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  34.55 
 
 
474 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 
430 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.25 
 
 
357 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  32.39 
 
 
334 aa  75.5  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.25 
 
 
357 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 
438 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 
467 aa  75.1  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
499 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
770 aa  75.1  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
652 aa  74.7  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  39.39 
 
 
385 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
385 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50640  response regulator with metal dependent phosphohydrolase activity (two-component)  36.36 
 
 
347 aa  74.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0111  metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 
228 aa  74.3  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.153504  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
361 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  37.21 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  34.56 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.43 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 
513 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
508 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>