181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1276 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  100 
 
 		 508 aa  1060    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  78.8 
 
 		 497 aa  815    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  65.5 
 
 		 497 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  67.41 
 
 		 508 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  68.99 
 
 		 512 aa  744    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  28.1 
 
 		 460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  32.26 
 
 		 217 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  29.86 
 
 		 217 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  29.63 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  40.32 
 
 		 285 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  26.27 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  26.27 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  25.93 
 
 		 217 aa  67  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  25.36 
 
 		 210 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  26.09 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  27.83 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  27.81 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  30.19 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  25.48 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5812  thymidylate synthase  30.49 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  30.52 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0442  thymidylate synthase  27.32 
 
 		 296 aa  57  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1731  thymidylate synthase  27.32 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0805  hypothetical protein  23.42 
 
 		 238 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  27.45 
 
 		 241 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  26.78 
 
 		 210 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  28.16 
 
 		 264 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  30.22 
 
 		 264 aa  55.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  55.5  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  28.66 
 
 		 295 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  25.77 
 
 		 264 aa  54.3  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  25 
 
 		 264 aa  53.5  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  25.77 
 
 		 264 aa  53.5  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  26.54 
 
 		 264 aa  53.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  26.83 
 
 		 264 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  28.83 
 
 		 264 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  29.5 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  25.13 
 
 		 267 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  26.44 
 
 		 264 aa  52  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  26.44 
 
 		 264 aa  52  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  27.21 
 
 		 277 aa  51.6  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0622  thymidylate synthase  28.33 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  24.59 
 
 		 264 aa  50.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1745  thymidylate synthase-like protein  24.9 
 
 		 263 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0307935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  28.76 
 
 		 264 aa  50.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  27.74 
 
 		 244 aa  50.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  28.22 
 
 		 264 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  24.71 
 
 		 283 aa  50.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  30.16 
 
 		 260 aa  50.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  27.81 
 
 		 264 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  27.6 
 
 		 264 aa  50.1  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  26.14 
 
 		 264 aa  50.1  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02121  hypothetical protein  34.62 
 
 		 123 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  25.28 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  24.06 
 
 		 280 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1265  thymidylate synthase  23.93 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1188  thymidylate synthase  23.93 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122155  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  29.03 
 
 		 263 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1232  thymidylate synthase  23.93 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.902192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3125  thymidylate synthase  23.93 
 
 		 264 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  0.408001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  25.95 
 
 		 264 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  23.63 
 
 		 264 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2280  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  29.46 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  26.22 
 
 		 264 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  26.32 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  27.45 
 
 		 264 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  26.32 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  26.32 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  27.43 
 
 		 318 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  26.32 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  27.43 
 
 		 318 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  24.82 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  24.82 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  26.32 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1315  thymidylate synthase  29.34 
 
 		 279 aa  48.5  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.667766  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  28.46 
 
 		 264 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  25.49 
 
 		 264 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0351  hypothetical protein  32.76 
 
 		 134 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1063  thymidylate synthase  30.4 
 
 		 347 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  26.8 
 
 		 264 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  23.5 
 
 		 264 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  30.15 
 
 		 318 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  24.26 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01741  hypothetical protein  31.13 
 
 		 133 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  28.46 
 
 		 264 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  24.19 
 
 		 264 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  24.09 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  24.09 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  24.09 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  24.09 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  24.09 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  26.8 
 
 		 264 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  24.09 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  23.31 
 
 		 264 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  24.09 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  25.39 
 
 		 264 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  25.6 
 
 		 264 aa  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  24.09 
 
 		 318 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  29.6 
 
 		 278 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  25.15 
 
 		 264 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>