276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0947 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  100 
 
 		 264 aa  553  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  93.56 
 
 		 280 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  92.42 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  84.85 
 
 		 264 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  81.44 
 
 		 264 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  78.16 
 
 		 274 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  76.14 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  75.38 
 
 		 264 aa  438  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  75.75 
 
 		 277 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  75 
 
 		 283 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  71.97 
 
 		 264 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1116  thymidylate synthase  75.37 
 
 		 277 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  74.24 
 
 		 264 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1664  thymidylate synthase  73.13 
 
 		 289 aa  420  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  73.48 
 
 		 264 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  71.97 
 
 		 264 aa  421  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  71.59 
 
 		 264 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  71.59 
 
 		 264 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  71.59 
 
 		 264 aa  417  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  70.83 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  71.59 
 
 		 264 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  73.48 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1260  thymidylate synthase  73.51 
 
 		 282 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000721083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2986  thymidylate synthase  73.88 
 
 		 277 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  74.24 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  74.24 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1823  thymidylate synthase  72.76 
 
 		 284 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10557  hitchhiker  0.00355293 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  71.59 
 
 		 264 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  71.97 
 
 		 264 aa  417  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  71.97 
 
 		 264 aa  417  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  71.59 
 
 		 264 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1450  thymidylate synthase  72.01 
 
 		 279 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.810743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3125  thymidylate synthase  71.21 
 
 		 264 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  0.408001 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  71.21 
 
 		 264 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  70.83 
 
 		 264 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  71.21 
 
 		 264 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  70.83 
 
 		 264 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  72.41 
 
 		 265 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  71.21 
 
 		 264 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  71.21 
 
 		 264 aa  414  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  71.21 
 
 		 264 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  71.59 
 
 		 264 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  71.21 
 
 		 264 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  71.21 
 
 		 264 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1265  thymidylate synthase  70.83 
 
 		 264 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  71.21 
 
 		 264 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1188  thymidylate synthase  70.83 
 
 		 264 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4007  thymidylate synthase  73.66 
 
 		 266 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.0387456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  71.97 
 
 		 264 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  71.97 
 
 		 264 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2772  thymidylate synthase  73.13 
 
 		 276 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.023604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1232  thymidylate synthase  70.83 
 
 		 264 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.902192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3172  thymidylate synthase  71.38 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  72.14 
 
 		 267 aa  410  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  71.21 
 
 		 264 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  70.83 
 
 		 264 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2176  thymidylate synthase  73.28 
 
 		 270 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2112  thymidylate synthase  72.52 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  72.52 
 
 		 267 aa  411  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2099  thymidylate synthase  72.52 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2158  thymidylate synthase  72.52 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  72.14 
 
 		 265 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  70.45 
 
 		 264 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  70.5 
 
 		 271 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  67.87 
 
 		 277 aa  407  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  70.99 
 
 		 267 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  70.83 
 
 		 263 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0572  thymidylate synthase  68.59 
 
 		 277 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  69.7 
 
 		 264 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2380  thymidylate synthase  71.76 
 
 		 266 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029199 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  68.18 
 
 		 264 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  70.23 
 
 		 272 aa  400  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  68.18 
 
 		 264 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  70.11 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  68.56 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  68.94 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  70.45 
 
 		 264 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  70.45 
 
 		 264 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  70.08 
 
 		 264 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  68.18 
 
 		 264 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5812  thymidylate synthase  69.73 
 
 		 277 aa  394  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  70.83 
 
 		 264 aa  394  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  70.08 
 
 		 264 aa  395  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  68.94 
 
 		 264 aa  394  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  68.56 
 
 		 264 aa  396  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  66.67 
 
 		 264 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  68.18 
 
 		 264 aa  394  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  68.58 
 
 		 275 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  67.42 
 
 		 264 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0340  thymidylate synthase  67.14 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  68.18 
 
 		 264 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  68.18 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  69.32 
 
 		 264 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  68.18 
 
 		 264 aa  388  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  67.05 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  67.05 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  67.05 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17460  thymidylate synthase  67.54 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0442  thymidylate synthase  64.77 
 
 		 296 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  68.18 
 
 		 264 aa  384  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>