276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1516 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  100 
 
 		 318 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  100 
 
 		 318 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  85.22 
 
 		 318 aa  592  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  85.22 
 
 		 318 aa  592  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  67.85 
 
 		 318 aa  454  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  68.17 
 
 		 318 aa  455  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  68.49 
 
 		 318 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  68.17 
 
 		 318 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  67.85 
 
 		 318 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  67.52 
 
 		 318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  67.52 
 
 		 318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  67.52 
 
 		 318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  67.52 
 
 		 318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  67.85 
 
 		 318 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  67.52 
 
 		 318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  62.26 
 
 		 320 aa  419  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  55.97 
 
 		 318 aa  391  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0782  thymidylate synthase  57.05 
 
 		 319 aa  374  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.412058  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  54.29 
 
 		 322 aa  362  6e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl419  thymidylate synthase  55.31 
 
 		 288 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0183487  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  51.9 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  50.31 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17460  thymidylate synthase  50 
 
 		 276 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  51.28 
 
 		 264 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  51.28 
 
 		 264 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  50.32 
 
 		 285 aa  318  6e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  50.8 
 
 		 274 aa  316  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  50.63 
 
 		 267 aa  316  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  51.7 
 
 		 300 aa  315  5e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  49.04 
 
 		 264 aa  315  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  51.13 
 
 		 264 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  51.13 
 
 		 264 aa  314  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1116  thymidylate synthase  50.31 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  50.48 
 
 		 264 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  51.13 
 
 		 264 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  50.48 
 
 		 264 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  50.8 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  50.31 
 
 		 277 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  312  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  49.04 
 
 		 264 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  49.04 
 
 		 264 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  49.2 
 
 		 264 aa  312  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  48.56 
 
 		 265 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  50.32 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  51.45 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  50.8 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  49.03 
 
 		 283 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  49.37 
 
 		 267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  48.73 
 
 		 268 aa  309  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  49.03 
 
 		 272 aa  309  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  50.48 
 
 		 264 aa  309  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  48.16 
 
 		 276 aa  308  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  49.35 
 
 		 265 aa  308  6.999999999999999e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 286 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  51.45 
 
 		 264 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  48.06 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  49.84 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  48.56 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  49.84 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  50.16 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2176  thymidylate synthase  47.78 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160989  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  49.84 
 
 		 290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  47.74 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  50.8 
 
 		 280 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  47.44 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  49.84 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  48.55 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  49.84 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  50.8 
 
 		 264 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  47.84 
 
 		 277 aa  305  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  49.2 
 
 		 264 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0234  thymidylate synthase  47.91 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  48.23 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  48.23 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  49.06 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  48.71 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  49.84 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4007  thymidylate synthase  48.39 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.0387456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  48.55 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  47.76 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  49.36 
 
 		 290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>