277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2314 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  100 
 
 		 290 aa  608  1e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  86.67 
 
 		 300 aa  550  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  79.08 
 
 		 286 aa  488  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  63.08 
 
 		 264 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  63.08 
 
 		 264 aa  367  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  62.72 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  62.01 
 
 		 264 aa  364  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  62.01 
 
 		 264 aa  364  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  62.72 
 
 		 264 aa  363  1e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  62.72 
 
 		 264 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  61.65 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  62.37 
 
 		 264 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  62.37 
 
 		 264 aa  361  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  61.65 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  60.57 
 
 		 264 aa  358  5e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  60.57 
 
 		 264 aa  358  5e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  62.82 
 
 		 264 aa  358  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  61.29 
 
 		 264 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  60.57 
 
 		 264 aa  356  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  60.57 
 
 		 280 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  60.93 
 
 		 264 aa  354  7.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  59.25 
 
 		 277 aa  354  8.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  60.93 
 
 		 264 aa  354  8.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  60.22 
 
 		 264 aa  353  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  61.37 
 
 		 264 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  59.5 
 
 		 264 aa  351  8e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  59.86 
 
 		 264 aa  350  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  59.5 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  60.65 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  57.19 
 
 		 274 aa  350  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  59.86 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 264 aa  349  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 264 aa  349  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  59.14 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  59.5 
 
 		 264 aa  349  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  60.57 
 
 		 264 aa  348  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  58.42 
 
 		 264 aa  348  6e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  58.9 
 
 		 277 aa  348  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  61.29 
 
 		 264 aa  348  8e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  55.81 
 
 		 283 aa  347  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 264 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  58.42 
 
 		 264 aa  347  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  58.78 
 
 		 264 aa  347  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  58.06 
 
 		 264 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  57.71 
 
 		 264 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  57.71 
 
 		 264 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  57.71 
 
 		 264 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 264 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  59.5 
 
 		 264 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  59.64 
 
 		 285 aa  346  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1242  thymidylate synthase  58.22 
 
 		 274 aa  345  4e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0595722  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  59.5 
 
 		 264 aa  345  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  58.06 
 
 		 264 aa  345  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 264 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  58.06 
 
 		 264 aa  345  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  59.14 
 
 		 264 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  57.93 
 
 		 274 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  58.22 
 
 		 277 aa  343  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  57.71 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1116  thymidylate synthase  58.98 
 
 		 277 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  61.73 
 
 		 272 aa  343  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  57.35 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  57.35 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  57.35 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  57.35 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  59.5 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  58.42 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  58.06 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  59.51 
 
 		 283 aa  342  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  57.35 
 
 		 264 aa  342  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  57.35 
 
 		 264 aa  342  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  57.35 
 
 		 264 aa  342  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  57.35 
 
 		 264 aa  342  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  59.86 
 
 		 264 aa  341  8e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2986  thymidylate synthase  57.63 
 
 		 277 aa  341  8e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  58.31 
 
 		 277 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  56.63 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  58.78 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  56.63 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  56.63 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  56.63 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  56.63 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  56.99 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  58.84 
 
 		 271 aa  339  4e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4007  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 266 aa  339  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.0387456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  57.35 
 
 		 264 aa  339  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  56.99 
 
 		 264 aa  338  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0544  thymidylate synthase  57.35 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.249699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  56.99 
 
 		 264 aa  338  7e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  57.65 
 
 		 264 aa  338  8e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  59.5 
 
 		 264 aa  337  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  56.63 
 
 		 264 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5812  thymidylate synthase  58.87 
 
 		 277 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1030  thymidylate synthase  58.99 
 
 		 266 aa  336  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  58.06 
 
 		 264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  56.63 
 
 		 264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  56.63 
 
 		 264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2176  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  57.71 
 
 		 264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  58.06 
 
 		 264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>