275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2331 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  100 
 
 		 286 aa  601  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  79.08 
 
 		 290 aa  488  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  80.14 
 
 		 300 aa  485  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  62.82 
 
 		 264 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  63.54 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  62.09 
 
 		 280 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  62.45 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  62.45 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  62.09 
 
 		 264 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  61.72 
 
 		 277 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  62.09 
 
 		 264 aa  363  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  60.69 
 
 		 277 aa  363  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  61.37 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 264 aa  362  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  62.23 
 
 		 264 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  62.23 
 
 		 264 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  60.79 
 
 		 264 aa  361  8e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  60.43 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 264 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 271 aa  355  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  59.21 
 
 		 264 aa  355  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  58.48 
 
 		 264 aa  351  7e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  56.52 
 
 		 283 aa  351  8e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 272 aa  351  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  349  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  58.48 
 
 		 264 aa  348  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  58.57 
 
 		 274 aa  348  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  60.65 
 
 		 265 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  59.57 
 
 		 264 aa  347  1e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  58.12 
 
 		 264 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  59.72 
 
 		 285 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  59.29 
 
 		 265 aa  345  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  57.19 
 
 		 264 aa  345  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  58.48 
 
 		 264 aa  345  7e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  58.84 
 
 		 264 aa  344  8.999999999999999e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  57.19 
 
 		 264 aa  344  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  58.12 
 
 		 264 aa  343  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4007  thymidylate synthase  58.84 
 
 		 266 aa  344  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.0387456 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  56.21 
 
 		 274 aa  343  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  58.84 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1116  thymidylate synthase  58.45 
 
 		 277 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  59.35 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  57.76 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  58.12 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0572  thymidylate synthase  56.9 
 
 		 277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  57.59 
 
 		 277 aa  342  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1030  thymidylate synthase  58.06 
 
 		 266 aa  342  4e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  58.12 
 
 		 264 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  58.12 
 
 		 264 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  58.12 
 
 		 264 aa  342  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0442  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 296 aa  342  5.999999999999999e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 267 aa  342  5.999999999999999e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  58.12 
 
 		 264 aa  341  5.999999999999999e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  57.76 
 
 		 264 aa  341  7e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 267 aa  341  7e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  57.75 
 
 		 277 aa  341  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  57.91 
 
 		 264 aa  341  9e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  57.4 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  57.55 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  57.76 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  58.63 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1731  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  339  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  339  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  56.79 
 
 		 283 aa  339  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  339  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  339  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  58.27 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1242  thymidylate synthase  56.36 
 
 		 274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  58.48 
 
 		 263 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1260  thymidylate synthase  57.84 
 
 		 282 aa  338  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000721083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  57.04 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  57.04 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1904  thymidylate synthase  56.55 
 
 		 272 aa  338  5e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  58.12 
 
 		 264 aa  338  5.9999999999999996e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  57.91 
 
 		 264 aa  338  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  57.04 
 
 		 264 aa  338  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  57.04 
 
 		 264 aa  338  7e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  57.04 
 
 		 264 aa  337  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  58.84 
 
 		 264 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2986  thymidylate synthase  55.63 
 
 		 277 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  337  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  57.19 
 
 		 264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2176  thymidylate synthase  58.8 
 
 		 270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  57.04 
 
 		 264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2099  thymidylate synthase  57.76 
 
 		 266 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  57.04 
 
 		 264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2112  thymidylate synthase  57.76 
 
 		 266 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2158  thymidylate synthase  57.76 
 
 		 266 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2432  thymidylate synthase  58.7 
 
 		 279 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  57.4 
 
 		 264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  56.68 
 
 		 264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  56.32 
 
 		 264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>