269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1904 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1904  thymidylate synthase  100 
 
 		 272 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  70.04 
 
 		 277 aa  414  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  69.31 
 
 		 277 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  66.79 
 
 		 277 aa  404  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  66.06 
 
 		 264 aa  381  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1242  thymidylate synthase  65.69 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0595722  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  64.26 
 
 		 264 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  64.98 
 
 		 264 aa  374  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0340  thymidylate synthase  62.54 
 
 		 283 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  60.42 
 
 		 283 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  65.7 
 
 		 264 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  67.15 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  65.7 
 
 		 264 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  65.34 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  66.43 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  64.98 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  64.26 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  63.54 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  64.98 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  63.54 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  63.54 
 
 		 264 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  62.82 
 
 		 264 aa  364  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  63.18 
 
 		 264 aa  364  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  64.26 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0572  thymidylate synthase  62.09 
 
 		 277 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  62.82 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  62.82 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  62.45 
 
 		 264 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  60.22 
 
 		 274 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1188  thymidylate synthase  60.65 
 
 		 264 aa  361  8e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  62.09 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3125  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  0.408001 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1265  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 264 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1232  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 264 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.902192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2432  thymidylate synthase  61.29 
 
 		 279 aa  359  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  60.65 
 
 		 264 aa  358  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  61.37 
 
 		 264 aa  357  9e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  59.93 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  64.26 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  60.65 
 
 		 264 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  62.09 
 
 		 264 aa  355  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  61.73 
 
 		 264 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  63.54 
 
 		 264 aa  354  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  63.18 
 
 		 264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  60.65 
 
 		 264 aa  351  8.999999999999999e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  62.82 
 
 		 264 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  62.55 
 
 		 271 aa  348  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  61.37 
 
 		 264 aa  348  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  348  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  60.73 
 
 		 274 aa  348  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  58.84 
 
 		 280 aa  347  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  61.73 
 
 		 264 aa  347  9e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  59.21 
 
 		 264 aa  345  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 264 aa  346  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  58.84 
 
 		 264 aa  345  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  59.21 
 
 		 264 aa  345  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  61.37 
 
 		 264 aa  345  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 264 aa  344  8e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  61.37 
 
 		 264 aa  343  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  60.14 
 
 		 273 aa  343  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  59.21 
 
 		 264 aa  343  1e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  57.04 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  58.84 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  58.48 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  60.29 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 264 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  61.01 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  61.37 
 
 		 264 aa  341  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  59.78 
 
 		 283 aa  340  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  57.76 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  56.55 
 
 		 286 aa  338  4e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  58.12 
 
 		 264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  59.21 
 
 		 264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2311  thymidylate synthase  59.44 
 
 		 273 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  59.21 
 
 		 264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  58.48 
 
 		 264 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  58.48 
 
 		 264 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  58.03 
 
 		 285 aa  335  5.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  58.12 
 
 		 264 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1823  thymidylate synthase  57.8 
 
 		 284 aa  333  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10557  hitchhiker  0.00355293 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  58.84 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  58.84 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  58.55 
 
 		 265 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  59.85 
 
 		 267 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  59.57 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  58.12 
 
 		 264 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1664  thymidylate synthase  57.8 
 
 		 289 aa  332  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  59.21 
 
 		 264 aa  332  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>