276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2348 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  100 
 
 
318 aa  669    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  99.37 
 
 
318 aa  665    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  99.37 
 
 
318 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  99.69 
 
 
318 aa  667    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  99.69 
 
 
318 aa  668    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  99.37 
 
 
318 aa  665    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  100 
 
 
318 aa  669    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  99.37 
 
 
318 aa  665    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  98.74 
 
 
318 aa  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  99.06 
 
 
318 aa  664    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  93.71 
 
 
318 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  69.75 
 
 
320 aa  474  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  67.85 
 
 
318 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  67.85 
 
 
318 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  65.59 
 
 
318 aa  448  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  65.59 
 
 
318 aa  448  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  66.35 
 
 
318 aa  449  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  62.11 
 
 
322 aa  436  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0782  thymidylate synthase  58.93 
 
 
319 aa  411  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.412058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  55.45 
 
 
264 aa  360  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  53.53 
 
 
264 aa  355  6.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  54.02 
 
 
264 aa  350  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  52.55 
 
 
285 aa  348  7e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  53.35 
 
 
264 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  54.02 
 
 
264 aa  345  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  52.41 
 
 
264 aa  345  6e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  51.28 
 
 
264 aa  344  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  53.38 
 
 
264 aa  344  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  54.34 
 
 
264 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  54.34 
 
 
264 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  51.92 
 
 
264 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  52.73 
 
 
264 aa  342  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  51.6 
 
 
264 aa  342  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  53.7 
 
 
264 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  51.28 
 
 
264 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  54.02 
 
 
280 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  53.7 
 
 
264 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  52.41 
 
 
264 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  53.04 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  51.44 
 
 
264 aa  339  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  50.8 
 
 
264 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  52.4 
 
 
264 aa  338  5.9999999999999996e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  52.88 
 
 
264 aa  338  8e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  53.21 
 
 
264 aa  338  8e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  52.09 
 
 
264 aa  338  9e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  51.6 
 
 
264 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  50.16 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  52.72 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  50.8 
 
 
264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  51.44 
 
 
264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  51.45 
 
 
264 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  51.6 
 
 
264 aa  335  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  50.16 
 
 
264 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  51.38 
 
 
277 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  52.56 
 
 
264 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  49.68 
 
 
264 aa  334  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  52.56 
 
 
264 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  51.09 
 
 
273 aa  333  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  52.34 
 
 
286 aa  333  2e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  52.88 
 
 
264 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  52.72 
 
 
271 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  51.54 
 
 
277 aa  332  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  51.12 
 
 
264 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  50.16 
 
 
264 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  53.21 
 
 
264 aa  332  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  51.6 
 
 
264 aa  331  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  50.8 
 
 
264 aa  331  1e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1242  thymidylate synthase  51.54 
 
 
274 aa  331  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0595722  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  51.13 
 
 
264 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  51.13 
 
 
264 aa  329  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  51.13 
 
 
264 aa  329  5.0000000000000004e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  50.77 
 
 
277 aa  328  5.0000000000000004e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  50.48 
 
 
264 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  50.8 
 
 
264 aa  328  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  50.96 
 
 
264 aa  328  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  50 
 
 
264 aa  328  7e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  50.15 
 
 
274 aa  328  9e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  50.8 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  51.45 
 
 
264 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  50.8 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  50.8 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  50.96 
 
 
264 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  51.75 
 
 
274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  50.64 
 
 
264 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  49.4 
 
 
283 aa  326  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  50.48 
 
 
264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  50.32 
 
 
264 aa  325  6e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  50.32 
 
 
264 aa  325  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  51.13 
 
 
263 aa  325  7e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  49.68 
 
 
264 aa  324  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  52.02 
 
 
300 aa  324  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  49.68 
 
 
264 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  49.68 
 
 
264 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  50.48 
 
 
264 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  51.28 
 
 
264 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  51.28 
 
 
264 aa  323  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  51.28 
 
 
264 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  51.28 
 
 
264 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  51.28 
 
 
264 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  50.62 
 
 
283 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>