278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0830 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  100 
 
 		 318 aa  661    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  70.38 
 
 		 320 aa  471  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  67.61 
 
 		 318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  66.04 
 
 		 318 aa  447  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  66.35 
 
 		 318 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  66.04 
 
 		 318 aa  447  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  66.35 
 
 		 318 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  66.35 
 
 		 318 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  65.72 
 
 		 318 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  65.72 
 
 		 318 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  65.72 
 
 		 318 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  65.72 
 
 		 318 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  65.72 
 
 		 318 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  63.35 
 
 		 322 aa  429  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0782  thymidylate synthase  62.38 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.412058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  58.1 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  58.1 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  55.97 
 
 		 318 aa  391  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  55.97 
 
 		 318 aa  391  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  54.02 
 
 		 264 aa  322  4e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  51.27 
 
 		 267 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  52.09 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  52.41 
 
 		 264 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  52.09 
 
 		 264 aa  316  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  50.8 
 
 		 264 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  50.79 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  51.77 
 
 		 264 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  51.45 
 
 		 264 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  51.13 
 
 		 264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  52.73 
 
 		 264 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  51.28 
 
 		 264 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  52.73 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  52.73 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  50.8 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  51.45 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  51.45 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  51.13 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  52.09 
 
 		 264 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  51.45 
 
 		 264 aa  309  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  50.48 
 
 		 264 aa  309  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  52.09 
 
 		 264 aa  308  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17460  thymidylate synthase  49.07 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  48.1 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  302  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  48.89 
 
 		 265 aa  301  7.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  51.1 
 
 		 290 aa  301  8.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  49.38 
 
 		 290 aa  300  1e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  48.57 
 
 		 264 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  49.2 
 
 		 264 aa  299  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  49.84 
 
 		 264 aa  298  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 280 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  50.48 
 
 		 264 aa  298  9e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  48.91 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  49.2 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  48.56 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  49.84 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  49.04 
 
 		 283 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  47.24 
 
 		 277 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  296  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  47.84 
 
 		 277 aa  295  7e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  295  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  49.84 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl419  thymidylate synthase  48.73 
 
 		 288 aa  294  2e-78  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0183487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  49.37 
 
 		 269 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  47.15 
 
 		 267 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  47.91 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  48.55 
 
 		 264 aa  292  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  46.62 
 
 		 264 aa  292  5e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  47.3 
 
 		 272 aa  292  5e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  49.2 
 
 		 264 aa  292  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  48.55 
 
 		 267 aa  291  9e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  48.24 
 
 		 264 aa  291  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  47.91 
 
 		 264 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  48.88 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  48.88 
 
 		 264 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  48.56 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  47.27 
 
 		 264 aa  289  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 264 aa  289  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  48.23 
 
 		 274 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  48.55 
 
 		 264 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  46.85 
 
 		 283 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  47.28 
 
 		 264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2176  thymidylate synthase  47.95 
 
 		 270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160989  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  47.91 
 
 		 271 aa  286  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  46.35 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  46.95 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  45.06 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  47.59 
 
 		 264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  47.6 
 
 		 264 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  46.15 
 
 		 278 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1904  thymidylate synthase  45.71 
 
 		 272 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  46.95 
 
 		 264 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>