121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0948 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  100 
 
 		 460 aa  920    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  30.27 
 
 		 508 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  26.32 
 
 		 512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  26.77 
 
 		 497 aa  161  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  28.1 
 
 		 508 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  24.19 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  28.64 
 
 		 217 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  34.63 
 
 		 215 aa  108  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  29.77 
 
 		 217 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  29.13 
 
 		 210 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  27.4 
 
 		 212 aa  87.4  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  37.17 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  28.11 
 
 		 210 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  28.33 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  27.54 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  33.61 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0637  hypothetical protein  31.25 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0735  hypothetical protein  32.14 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.412282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  28.44 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  25.81 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1977  thymidylate synthase  33.9 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  35.96 
 
 		 241 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1715  hypothetical protein  28.98 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0893595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  28.38 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.325057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  31.62 
 
 		 264 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1063  thymidylate synthase  27.82 
 
 		 347 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  29.07 
 
 		 264 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  27.03 
 
 		 267 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  27.49 
 
 		 267 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  26.28 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  25.12 
 
 		 260 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  28.73 
 
 		 264 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  27.83 
 
 		 264 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  29.17 
 
 		 264 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1673  hypothetical protein  37.5 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.293824  hitchhiker  0.0000000161519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  28.99 
 
 		 325 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  27.01 
 
 		 264 aa  50.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  27.01 
 
 		 264 aa  50.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3787  thymidylate synthase  28.33 
 
 		 308 aa  50.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  27.17 
 
 		 264 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  30.33 
 
 		 342 aa  50.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  26.59 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  27.03 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  27.12 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  28.18 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  22.32 
 
 		 217 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  30.54 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  29.28 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17460  thymidylate synthase  29.58 
 
 		 276 aa  49.3  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  27.54 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  28.88 
 
 		 264 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  32.08 
 
 		 264 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  32.08 
 
 		 264 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  21.86 
 
 		 217 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  28.57 
 
 		 264 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  23.81 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  31.88 
 
 		 275 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  26.85 
 
 		 272 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5812  thymidylate synthase  29.41 
 
 		 277 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  21.86 
 
 		 217 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  30.56 
 
 		 286 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  26.73 
 
 		 264 aa  48.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1682  thymidylate synthase  28.67 
 
 		 338 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  27.94 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1631  thymidylate synthase  23.95 
 
 		 279 aa  47.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  30.16 
 
 		 283 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0622  thymidylate synthase  22.89 
 
 		 286 aa  47.4  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  26.07 
 
 		 267 aa  47.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  27.49 
 
 		 264 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  27.54 
 
 		 264 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  29.71 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  29.03 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  30.43 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0215  dihydropteroate synthase-related protein  39.02 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  31.82 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  26.88 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5141  thymidylate synthase  27.59 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1315  thymidylate synthase  22.29 
 
 		 279 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.667766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0390  thymidylate synthase  28.08 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.137762  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2987  thymidylate synthase  29.46 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.177483  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2044  thymidylate synthase  27.7 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3946  thymidylate synthase  27.07 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  27.83 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5194  thymidylate synthase  26.72 
 
 		 323 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0324  thymidylate synthase  26.72 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.565505  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  26.81 
 
 		 264 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  32.77 
 
 		 277 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  27.08 
 
 		 264 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  29.92 
 
 		 264 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  24.84 
 
 		 320 aa  45.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  28.99 
 
 		 318 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  28.81 
 
 		 264 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  29.49 
 
 		 264 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4840  thymidylate synthase  26.72 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5373  thymidylate synthase  26.81 
 
 		 323 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  28.45 
 
 		 499 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1731  thymidylate synthase  25 
 
 		 264 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>